寶可夢(mèng)是與我們共同生活在這個(gè)星球上不可思議的生物，在這個(gè)世界上，既有與人類共同生活的寶可夢(mèng)，也有生活在草叢、天空、以及在水里的野生寶可夢(mèng)。住在關(guān)都地區(qū)，形單影只的皮丘遇見(jiàn)了袋獸母子，此后便與他們共同生活，并最終進(jìn)化成了皮卡丘。幾年后，生活在真新鎮(zhèn)的10歲少年小智與皮卡丘受到大木博士的邀請(qǐng)，參加枯葉市櫻木研究所的落成典禮。在此，小智在追逐幻之寶可夢(mèng)洛奇亞的過(guò)程中與小豪相遇了。目標(biāo)與最強(qiáng)王者丹帝對(duì)戰(zhàn)的小智，以及夢(mèng)想收服所有寶可夢(mèng)并追尋夢(mèng)幻的小豪，二人以櫻木研究所特別調(diào)查員的身份出發(fā)，在不同地區(qū)展開(kāi)調(diào)查，邂逅了各種各樣不可思議的寶可夢(mèng)，還在旅途中收服了新的搭檔。